W źródłach pisanych Kjustendił został po raz pierwszy wspomniany w 135 r. pod nazwą Pautalia.
Cesarz Konstantyn Wielki (306-337) przebywał przez długi czas w Serdiki i zasłynął powiedzeniem „Serdika to mój Rzym".
W latach 1004-1018, pod rządami lokalnego feudała Krakra z Pernika, twierdza Pernik wytrzymała dwa oblężenia i odegrała ważną rolę w oporze Bułgarii przeciwko Cesarstwu Bizantyjskiemu.
W 1865 r. miejscowość Samundżiewo została ogłoszona miastem i centrum rejonowym pod nazwą Orchanie, dzisiejszy Botewgrad
W dniu 03.04.1879 r. Sofia została wybrana stolicą Bułgarii.
Bitwa pod Sliwnicą w dniach 17-19 listopada 1885 r. była punktem zwrotnym w wojnie serbsko-bułgarskiej. Po klęsce Bułgarzy wycofali się i zdołali obronić Zjednoczenie.
W 1918 roku Radomir stał się centrum Powstania Żołnierskiego. Wtedy 27 września 1918 r. Bułgaria została po raz pierwszy ogłoszona republiką.
W dniu 17.03.1943 r. Dimityr Peszew wystosował ostry list protestacyjny do premiera Bogdana Fiłowa przeciwko deportacji bułgarskich Żydów, co dało impuls do narodowego oporu na rzecz ich ratowania. Dom D. Peszewa - Zbawiciela bułgarskich Żydów w Kjustendilu został odrestaurowany i przekształcony w muzeum.