Das Museum befindet sich im Unterkuppelraum des Nordflügels der Sofia-Universität „St. Kliment Ohridski“ und präsentiert in zwei verschiedenen Ausstellungen - zur Paläontologie und zur historischen Geologie - die wichtigsten fossilen wirbellosen und teilweise pflanzlichen Organismen, Gesteinsproben, Fossilien usw. Der Stolz des Museums ist jedoch das imposante Skelett (7 m lang und 4,20 m hoch) eines Deinotheriums - riesiges Säugetier, verwandt mit den Mammuts und den Elefanten.
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