1956 yılında kurulmuş ve ilk sergisi "Aziz Yoan Krastitel" kilisesinde düzenlenmiştir. 1994 yılında yeni binasına taşınmıştır. Antik Mesambriya ve Orta Çağ Nesebar'ın tarihini gösteren çok sayıda kültürel anıtın yer aldığı "Çağlar boyunca Nesebar" sergisi burada düzenlenmektedir. Müzenin sergi alanında bir lobi ve dört salon bulunmaktadır.