El Museo Arqueológico de Nesebar fue establecido en 1956, y su primera exposición se organizó en la iglesia de "San Juan Bautista". Se trasladó a su nueva ubicación en 1994. Aquí se encuentra la exposición "Nesebar a lo largo de los siglos", que presenta numerosos monumentos culturales que ilustran la historia de la Mesembria antigua y la Nesebar medieval. La superficie de exposición del museo abarca el vestíbulo y cuatro salas.