Das archäologische Museum von Nessebar wurde 1956 gegründet und seine erste Ausstellung wurde in der Kirche „St. Johannes der Täufer“ dargestellt. 1994 wurde das Museum in sein neues Gebäude versetzt. Hier befindet sich die Ausstellung „Nessebar im Laufe der Jahrhunderte“, welche zahlreiche Kulturdenkmäler präsentiert, die die Geschichte der antiken Messambria und des mittelalterlichen Nessebar illustrieren. Die Ausstellungsfläche des Museums umfasst ein Foyer und vier Säle.